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NGS测序原理和实验方法

 更新时间:2023-08-10 点击量:615

二代测序(Next-Generation Sequencing,简称NGS)是一种高通量测序技术,广泛应用于基因组学、转录组学、表观遗传学等研究领域。本文将介绍NGS测序的原理和实验方法。

一、NGS测序原理

NGS测序原理基于DNA片段的扩增和高通量测序技术。主要步骤如下:

1. 样品制备:将需要测序的DNA样品进行提取和纯化处理。

2. DNA片段化:将DNA样品切割成较小的片段。通常采用超声波或限制性内切酶进行切割。

3. 适配体连接:在DNA片段两端连接适配体,适配体包含特定序列用于后续连接和测序反应。

4. DNA片段扩增:通过PCR或桥式扩增等方法将DNA片段进行扩增,使得每个DNA片段形成数以百万计的复制品。

5. 片段固定:将扩增的DNA片段固定在固定板上。每个DNA片段在固定板上形成一个独立的簇。

6. 测序反应:通过引物识别和链延伸等技术对固定的DNA片段进行测序反应。每个DNA片段会在反应中逐个添加碱基,并利用荧光信号记录每个碱基的顺序。

7. 图像捕获:使用高分辨率摄像机捕获电荷耦合器件(CCD)上荧光信号的图像。

8. 数据分析:根据图像数据和序列信息进行测序数据的分析和解读。

二、NGS测序实验方法

NGS测序实验包含样品制备、测序仪器设置、数据采集和数据分析等步骤。具体步骤如下:

1. 样品制备:根据研究目的选择合适的样品,例如细胞、组织或血清等。将样品进行DNA提取、纯化和片段化处理。

2. 适配体连接:将适配体连接到DNA片段两端。连接适配体时需要考虑适配体的质量和效率,可以选择商业化的适配体连接试剂盒。

3. DNA片段扩增:对连接适配体的DNA片段进行扩增。扩增方法可以根据研究需求选择PCR、桥式扩增或旋转扩增等技术。

4. 文库构建:将扩增的DNA片段转化为文库。文库构建包括文库准备、文库浓度测定等步骤。

5. 测序仪器设置:根据实验需求选择合适的NGS测序仪器。设置测序参数,如测序深度、读长、文库密度等。

6. 数据采集:将文库加载到NGS测序仪器中,启动测序反应并将荧光信号采集到计算机中。

7. 数据分析:对采集到的图像和序列数据进行质量控制、序列比对、变异检测、拼接等数据分析步骤。可以利用商业化的分析软件或自行开发脚本进行数据分析。

NGS测序技术的发展革命性地改变了基因组学和其他生命科学领域的研究方式。其高通量、高效率、低成本的特点使得大规模测序成为可能,为生命科学研究提供了更广阔的应用空间。随着技术的不断进步和成本的不断降低,NGS测序将会在医学研究、生命科学等领域发挥更加重要的作用。

苏州阿尔法生物提供的天根试剂盒主要有质粒大提、质粒小提等各种质粒抽提试剂盒、血液DNA提取试剂盒、细菌DNA提取试剂盒、病毒RNA提取试剂盒、NGS文库构建、植物组织DNA提取试剂盒等各种基因组提取试剂盒。还有DH5感受态等。