琼脂糖核酸电泳步骤
1. 用蒸馏水将制胶模具和梳子冲洗干净, 放在制胶平板上, 封闭模具边缘, 架好梳子;
2. 根据欲分离 DNA 片段大小用凝胶缓冲液配制适宜浓度的琼脂糖凝胶:准确 称量琼脂糖干粉, 加入到配胶用的三角烧瓶内, 定量加入电泳缓冲液(一般
20~30 ml);
3. 放入到微波炉内加热熔化。冷却片刻, 加入一滴荧光染料,轻轻旋转以充分
混匀凝胶溶液,倒入电泳槽中,待其凝固;
4. 室温下 30~45 分钟后凝胶全凝结, 小心拔出梳子, 将凝胶安放在电泳槽内;
5. 向电泳槽中倒入电泳缓冲液,其量以没过胶面 1mm 为宜,如样品孔内有气
泡,应设法除去;
6. 在 DNA 样品中加入 10×体积的载样缓冲液(loading buffer),混匀后,用枪
将样品混合液缓慢加入被浸没的凝胶加样孔内;
7. 接通电源, 红色为正极,黑色为负极, 切记 DNA 样品由负极往正极泳动 (靠
近加样孔的一端为负)。一般 60 ~ 100V 电压,电泳 20 ~ 40min 即可;
8. 根据指示剂泳动的位置,判断是否终止电泳;
9. 电泳完毕, 关上电源, 在凝胶成像仪上观察电泳带及其位置,并与核酸分子
量标准 Marker 比较被扩增产物的大小。
琼脂糖凝胶浓度与线形 DNA 的最佳分辨范围 | |
琼脂糖凝胶浓度 | 线形 DNA 的最佳分辨范围(bp) |
0.5% | 1,000 ~ 30,000 |
0.7% | 800 ~ 12,000 |
1.0% | 500 ~ 10,000 |
1.2% | 400 ~ 7,000 |
1.5% | 200 ~ 3,000 |
2.0% | 50 ~ 2,000 |
胶回收纯化 DNA
1. 琼脂糖电泳,将特异电泳带用刀切下放入到 EP 管中,称琼脂糖带的重量;
2. 按照每 100mg 加 400µl 的量加入binding buffer,放入到 EP 管振荡器中,45℃ ~
55℃温育振荡,直到所有的琼脂糖都溶解(大概要 5 分钟 );
3. 取出纯化柱, 将上述溶解液转移至柱中, 室温下放置 2 分钟, 8,000rpm 离心
1 分钟,弃 EP 管中的液体,将纯化柱放回 EP 管中;
4. 加 500µl 的 wash buffer 至柱中, 8,000rpm 离心 1 分钟。弃管中的溶液;
5. 重复操作 4 步的操作 1 次,最后将纯化柱放入 EP 管中 10,000rpm 离心 30 秒,
除去痕量的 wash buffer;
6. 将纯化柱放入一个新的 EP 管。加 30~40µl H2O 或者 elution buffer 至纯化柱膜 的中央,在37℃或 50℃下放置 2 分钟, 10,000rpm 离心 1 分钟洗脱 DNA,将
EP 管中的 DNA 溶液放在-20℃保存。
7. 注: 若想要不电泳而直接纯化 DNA 溶液, 只需要在第 2 步中按 100µl 液量加 400µl 的 binding buffer,其余的步骤不变。