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分子生物学试剂在基因测序技术中的核心作用

更新时间:2025-07-18点击次数:48
  分子生物学试剂在基因测序技术中扮演着至关重要的角色,其核心作用贯穿了从样本处理、文库构建到测序反应的全过程。
  以下是分子生物学试剂关键功能与应用的详细解析:
  1.样本处理与核酸提取
  (1)裂解与纯化
  裂解试剂:
  化学裂解液(如胍盐、表面活性剂):破坏细胞膜和核膜,释放核酸。
  酶解法(如蛋白酶K、溶菌酶):降解与核酸结合的蛋白质(如组蛋白)。
  物理辅助(如珠磨法、超声破碎):通过机械力加速细胞裂解。
  纯化试剂:
  硅膜吸附柱:利用硅胶膜特异性吸附DNA/RNA,去除杂质(如蛋白质、多糖、抑制剂)。
  磁珠法:磁性纳米颗粒结合核酸,通过磁性分离快速纯化。
  缓冲液系统(如高盐低pH):优化核酸与杂质的结合差异,提升纯度。
  (2)核心作用
  确保核酸的完整性(避免断裂)和高纯度(去除PCR抑制剂),为后续步骤提供高质量模板。
  2.文库构建(LibraryPreparation)
  (1)核酸片段化
  酶法片段化:
  DNaseI:随机切割DNA链,产生平末端或粘性末端。
  转座酶(Tagmentation):同时完成片段化和接头添加(如Nextera技术)。
  超声片段化:
  超声波将DNA打断为特定长度片段(如100~500bp),需配合稳定剂(如Covaris试剂盒)。
  (2)接头连接与修饰
  接头(Adapter):
  包含测序引物结合位点、索引序列(Index)和标签序列,用于区分不同样本。
  T4DNA连接酶:催化DNA片段与接头的共价连接。
  末端修复:
  Taq聚合酶:填补5'端突出末端,生成钝末端。
  Klenow酶:修复3'端凹槽并加dA尾(与TruSeq接头匹配)。
  磷酸化与连接效率增强剂:
  ATP和T4PNK酶:对接头进行5'磷酸化,提高连接稳定性。
  (3)核心作用
  确保文库的均一性(片段长度一致)和特异性(接头正确连接),避免测序偏差。
  3.分子生物学试剂测序反应中的试剂
  (1)PCR扩增与富集
  PCR试剂:
  HotStartTaq酶:减少非特异性扩增,提高文库富集效率。
  dNTPs:提供DNA合成原料,需平衡浓度以避免错误掺入。
  Mg??/DMSO:优化PCR反应体系的离子强度和变性温度。
  目的:通过有限循环PCR(如10~15次)放大文库,避免过度扩增导致偏好性。
  (2)测序模板制备
  单分子模板制备:
  乳液PCR(emulsionPCR):用于454焦磷酸测序,通过微珠包裹单个DNA片段进行扩增。
  桥式PCR(BridgePCR):在FlowCell表面生成DNA簇(如Illumina技术)。
  核心试剂:
  Phi29聚合酶:用于多重置换扩增(MDA),生成滚动环状DNA(RDA)。
  (3)测序反应体系
  荧光标记与终止剂:
  ddNTPs(双脱氧核苷酸):用于Sanger测序,终止链延伸并标记荧光。
  可逆终止剂:Illumina边合成边测序(SBS)中使用,暂时阻断链延伸后化学去除。
  聚合酶与底物:
  DNA聚合酶:催化核苷酸掺入(如Illumina的高性能酶减少错误率)。
  引物与模板结合缓冲液:维持测序反应的高特异性。
 

 

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